Curriculum Vitae

Régis Debruyne
Approches synergiques de l’histoire évolutive des mammifères: intégration de la paléogénomique, de la modélisation en phylogénétique et de la morpho-anatomie actuelle et fossile des éléphantidés (Mammalia, Proboscidea).

Formation académique

2000-2003

Thèse de doctorat du Muséum National d’Histoire Naturelle (Paris)
Allocation de recherche MENRT de l’Ecole doctorale Diversité du Vivant (ED 0392, Paris VI).
Titre: Différenciation morphologique et moléculaire des Elephantinae ; statut systématique de l’éléphant d’Afrique de forêt, Loxodonta africana cyclotis (MATSCHIE, 1900)
Directeur de Thèse: Prof. Pascal Tassy (UMR 5143 CNRS, Paléobiodiversité, MNHN)
Mention très honorable avec les félicitations du jury

1999-2000

DEA Biodiversité : Génétique, Histoire et Mécanismes de l’Évolution (ED 0392, Diversité du Vivant), université Paris XI
Sujet de recherche (7 mois) : phylogénie moléculaire des éléphants et des mammouths
Superviseur: Prof. Pascal Tassy (UMR 5143 CNRS, Paléobiodiversité, MNHN)
Mention TB; major

Juin 1999

Maîtrise de Biologie des Populations et des Écosystèmes, université Paris XI
Options: Évolution ; Biologie du Comportement Animal
Stage de recherche à la station biologique de Paimpont sur la démographie du lézard vivipare (Lacerta vivipara)
Mention B; 4ème/96

1997-1998

Licence de Biologie des Organismes, université Paris XI
Option: Zoologie
Mention AB; 9ème/151

1995-1997

DEUG de Biologie, université Paris XI
Option: Géologie
Mention AB; 1er décile

Juin 1995

Baccalauréat scientifique, lycée Robespierre (Arras, 62)
Option: Sciences de la Vie et de la Terre
Mention TB

Formation continue

Janvier 2009

Formation officielle (48 heures) à l’utilisation du système de séquençage Génomique GS TITANIUM de Roche Diagnostics/454 Life Sciences.

Avril 2007

Formation officielle (48 heures) à l’utilisation du système de séquençage Génomique GS FLX de Roche Diagnostics/454 Life Sciences, et formation à l’environnement informatique.

Septembre-Octobre 2006

Formation officielle (1 semaine) à l’utilisation du système de Séquençage Génomique GS20 de 454 Life Sciences.

Langues étrangères

Anglais courant (score TOEFL avril 2006: 1012/1020 + 3 ans au Canada anglophone)
Allemand (lu, écrit)
Latin

Expérience de recherche

16/06/06-15/08/09

Post-doc à l’université McMaster (Hamilton, Ontario, Canada) au sein du Ancient DNA Centre (Département d’Anthropologie) dirigé par le Prof. Hendrik Poinar

01/09/05-01/09/08

Attaché honoraire du Département Histoire de la Terre, Muséum national d’Histoire naturelle (Paris, France); UMR 5143 CNRS, Paléobiodiversité & Paléoenvironnements

01/10/03-31/08/05

Contrat d’Attaché Temporaire d’Enseignement et de Recherche
Université Pierre & Marie Curie (Paris VI)
Sous la Direction de Jacques Castanet (Prof. Paris VI)
FRE 2696, Adaptations et évolution des systèmes ostéo-musculaires – Équipe Formations Squelettiques

01/10/00-30/09/03

Contrat d’allocataire de recherche du Ministère de l’Education Nationale et de la Recherche (MENRT N°00809)
École doctorale Diversité du Vivant (ED 0392, Paris VI)
Sous la direction de Pascal Tassy (Prof. MNHN)
UMR 5143 CNRS, Paléobiodiversité & Paléoenvironnements
FR 1541 CNRS, Systématique moléculaire

Expérience d’enseignement

Année 2008

Intervenant extérieur pour la 4th year Class of Anthropology de l’université McMaster

2005-2006

Vacataire pour le Muséum national d’Histoire naturelle: master SEP et école Doctorale ED227 Sciences de la Nature et de l’Homme

01/10/03-31/08/05

Contrat d’Attaché Temporaire d’Enseignement et de Recherche (temps plein)
Université Pierre & Marie Curie (Paris VI), UFR 927 de Sciences de la Vie

01/10/00-30/09/03

Contrat de moniteur du CIES de Versailles
Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines, UFR des sciences
Sous la direction de Florence Richard (MCF Versailles)

Qualifications CNU
16/03/2007-17/03/2010

Section 67, BIOLOGIE DES POPULATIONS ET ECOLOGIE
Maître de Conférences
Maître de Conférences du Muséum National d’Histoire Naturelle

16/03/2004-17/03/2007

Section 68, BIOLOGIE DES ORGANISMES
Maître de Conférences (N°04268143244)
Maître de Conférences du Muséum National d’Histoire Naturelle (N°04468143244)

Encadrement de recherche

Avril 2009-présent

Co-supervision de la thèse de doctorat en biologie de Jacob M. Enk, au McMaster Ancient DNA Centre. Sujet de recherche: Populations, démographie, interactions et extinctions des mammouths en Amérique du Nord

Novembre 2008-Avril 2009

Supervision des travaux de Alison M. Devault, doctorante du McMaster Ancient DNA Centre. Sujet de recherche: diversité moléculaire des mammouths en Amérique du Nord. Optimisation moléculaire pour les échantillons de la zone tempérée

Janvier-Avril 2006

Encadrement du stage de laboratoire de quatrième année universitaire de Genevieve Chu au McMaster Ancient DNA Centre, Hamilton, Canada. Sujet de recherche: Préservation d’ADN et analyses phylogénétiques d’une collection de mammouths laineux du permafrost sibérien

Février-Juin 2005

Co-encadrement du stage de recherche de M2 de Mlle Marie-Lilith Patou au Service de Systématique Moléculaire, MNHN Paris. Sujet de recherche: ADN ancien et phylogénie moléculaire des civettes asiatiques (Master SDUEE, Paris VI)

Conférences internationales

23-26 Septembre 2009

Conférencier invité au congrès annuel de la Society for Vertebrate Paleontology (SVP) 2009, symposium “Molecular Tools in Paleobiology”, université de Bristol (UK)
Communication orale: Ancient DNA in revolutions and crises

14-16 Septembre 2009

Conférencier invité au congrès international du Réseau Français de Paléogénétique du CNRS, “Ancient DNA: from mitochondrial to nuclear DNA, from the evolution of populations to the selection of characters“, Institut Jacques Monod (IJM, Université Paris VII, Paris)
Communication orale: Revolutions and crises in ancient DNA: At the dawn of large-scale paleogenomics, what have we learnt from our previous mistakes?

4-7 Mai 2009

Conférencier invité au Workshop ADN ancien du réseau européen Evoltree, Borrowdale (UK)
Communication orale: Ancient DNA in revolutions and crises

5-8 Novembre 2008

Thirty-sixth Annual Meeting of the Canadian Association for Physical Anthropology, Hamilton, ON (Canada)
Ancient DNA in the genomics era: possibilities and potential pitfalls symposium (Session 10)
Communication orale: What controls for the new era of high throuput-sequencing in ancient DNA?

9-11 Septembre 2008

“Bring on The Metal”, first North American Genome Sequencer FLX User Group Meeting, New Haven, CT (USA)

31 Mars- 3 Avril 2007

Conférencier invité à “Creating the Biological Roadmap”, réunion annuelle de l’ABRF (Association of Biomolecular Resource Facilities), Tampa, FL (USA)
Communication orale: Sequencing Extinct Genomes

Septembre 2005

Second congrès international “The World of Elephants”, Hot Springs, SD (USA)
Communications orales:
I- Morphometrics and ontogenetic growth of Forest and Savannah African elephants
II- Phylogeography of Forest and Savannah African elephants

Juillet 2005

Neuvième International Mammalogical Congress (IMC9), Sapporo (Japan)
Communication orale: Advances in the phylogeography of African elephants
Poster: The mandibular canal in proboscideans: comparative anatomy and phylogenetic implications

Juillet 2003

Vingt-deuxième réunion annuelle de la Willi Hennig Society, Botanical Garden, New-York
Communication orale: How many species of African elephants ? Appraisal of an apparent molecular controversy

Octobre 2001

Premier congrès international “The World of Elephants”, Rome (Italie)
Communication orale: New mitochondrial data demonstrating a close relationship between Mammuthus primigenius (BLUMENBACH, 1799) and Loxodonta africana (BLUMENBACH, 1797)
Poster: Molecular phylogeny of living elephants and discussion on infraspecific systematics of Loxodonta africana and Elephas maximus

Mai 2000

Congrès bisannuel de la European Association of Zoos and Wildlife Veterinaries (EAZWV), MNHN, Paris
Communication orale: Coco Superstar.

Conférences nationales

20 Février 2009

Third National Bioscience Educators’ Conference du CBERC, Campus of York, Toronto (Canada).
Conférencier invité: DNA from fossils and the benefit of time travel

Mars 2004

Dixième anniversaire du service de systématique moléculaire du Muséum national d’Histoire naturelle, Paris.
Communication orale: Le mammouth et le thermocycleur.

Janvier 2004

Journée de travail de la société française de biologie
« La systématique aujourd’hui » (coordonnée par le Prof. Hervé le Guyader, Paris VI), Paris.
Communication orale: Apports de la phylogénie moléculaire et de la morphométrie à la systématique des éléphants d’Afrique.

Octobre 2003

Journées annuelles de la Société Française de Systématique (SFS)
Journées Avenir et pertinence des méthodes d’analyse en phylogénie moléculaire, Paris
Communication orale: Vers une phylogénétique non systématique?

Septembre 2000

Journées annuelles de la Société Française de Systématique (SFS)
Journées Systématique et Paléontologie, Paris
Poster : L’ADN du mammouth de Liakhov

Missions de terrain

15/08/05-25/08/05

Mission de terrain paléontologique: site d’Appelle (Tarn-et-Garonne), macrofaune de vertébrés de l’Oligocène inférieur (fouille Tassy, 2005)

14/04/04-27/04/04

Mission de terrain d’étude du statut des éléphants sauvages (réserve naturelle de Khao Yai) et en semi-captivité (National Elephant Institute, Lampang) de Thaïlande

01/08/02-14/08/02

Mission de prospection et d’échantillonnage moléculaire de mammouths laineux à Khatanga (péninsule du Taïmyr, Sibérie)

02/04/01-14/04/01

Mission de terrain paléontologique: site d’Appelle (Tarn-et-Garonne), macrofaune de vertébrés de l’Oligocène inférieur (fouille Tassy, 2001)

Juillet 1998

Stage de restauration sur le site archéologique de la Commanderie hospitalière de Sallebruneau (13ème siècle; Gironde, France)

Mai-Juin 1997

Stage de paléontologie de 6 semaines sur le site de La Belle-Roche (Pléistocène inférieur; province de Liège, Belgique)

Juillet-Août 1995

Stage de paléontologie de 7 semaines sur le site de la Caune de l’Arago à Tautavel (Pléistocène inférieur; centre européen de préhistoire, Pyrénées Orientales, France)

Missions muséographiques

29/11/05-01/01/06

Mission d’étude de la collection ostéologique d’Elephantidae fossiles du musée d’histoire naturelle de Nairobi (KNM, Kénya): recherche du morphotype ancestral

13/02/05-18/03/05

Étude de la collection des squelettes d’éléphants du muséum d’histoire naturelle de Berlin (Museum fur Naturkunde, Allemagne) : analyse qualitative, morphométrique et échantillonnage moléculaire

01/04/03-02/05/03

Étude de la collection de squelettes d’éléphants de l’Institut Royal des Sciences Naturelles de Belgique (IRSNB, Bruxelles): analyse qualitative, morphométrique et échantillonnage moléculaire

12/09/03-20/12/03

Étude de la collection de squelettes d’éléphants du Musée Royal d’Afrique Centrale de Tervuren (MRAC, Belgique): analyse qualitative, morphométrique et échantillonnage moléculaire

Bourses, financements et prix

Année 2007

Financement de mes analyses génétiques (sexage moléculaire et paléogénomique) d’une momie de jeune mammouth originaire de Yakoutie, par une “bourse découverte” du réseau Discovery Channel

15/05/06-15/08/06

“Short-term fellowship” de trois mois du Human Frontier Science Program (HFSP-00285C/2005) pour un projet de recherche à l’université McMaster (Hamilton, Ontario) intitulé: “Paleogenomics of the woolly mammoth: phylogenetic and functional analysis of molecular evolution”

Décembre 2005

Financement spécial de ma mission muséographique au KNM (Nairobi, Kénya) par le Département Histoire de la Terre (MNHN, Paris)

Juillet 2005

Co-financement de ma participation à la neuvième conférence internationale de mammalogie (IMC, Sapporo, Japon) par le Comité National des Sciences Biologiques (CNSB) et Japan Airlines

13/02/05-18/03/05

Financement de ma mission muséographique à Berlin par une bourse du programme européen synthesys

Année 2004

Obtention d’une bourse de l’Oréal Recherche à des fins de séquençage d’ADN ancien de mammouths laineux (mécénat scientifique)

Juillet 2004

Obtention du prix Marie Stope de la Willi Hennig society et co-financement de la Société française de systématique de ma participation au 22ème congrès de la WHS à New-York

01/04/03-02/05/03

Financement de ma mission muséographique à Bruxelles par une bourse de l’ancien programme européen ABC (desormais inclus dans synthesys)

01/08/02-14/08/02

Co-financement de ma mission sibérienne par le groupe CERPOLEX/MAMMUTHUS

01/10/00-30/09/03

Allocation de recherche du Ministère de l’Education Nationale et de la Recherche (MENRT N°00809)

Collaborations nationales et internationales

En cours

CERPOLEX/MAMMUTHUS

Congrégation internationale de recherche sur le mammouth auquel je participe en tant qu’expert ADN ancien

American Museum of Natural History (AMNH)

Collaboration avec Ross MacPhee, conservateur du département de mammalogie, sur les questions d’évolution et d’extinction des mammouths

University of Michigan, Ann Harbor

Collaboration avec Dan Fisher pour des analyses moléculaires d’éléphantoïdes d’Amérique du Nord, autour de la transition Pléistocène/Holocène

University of Wyoming

Collaboration avec David Liberles (génomique fonctionnelle des éléphantoïdes), et Mark T. Clementz pour l’analyse moléculaire de mammouths nords-américains

Yukon Paleontological Collections

Collaboration avec l’équipe de Grant Zazula du Yukon Beringia Interpretive Centre pour l’analyse moléculaire des collections de proboscidiens fossiles du nord-ouest canadien

University of Alaska, Fairbranks

Collaboration avec Paul Matheus pour de l’analyse moléculaire de restes sub-fossiles de proboscidiens de la frange nord de l’Alaska

Institute of Arctic Biology

Collaboration avec R. Dale Guthrie, professeur émérite, autour de l’analyse moléculaire de restes sub-fossiles de mammouths d’Alaska continentale et insulaire

Fondation Aane Mane (Bangalore, Inde)

Collaboration avec Prajna Chowta et Philippe Gautier, fondateurs de cette organisme dédié à la protection de l’éléphant asiatique: mitotypage d’éléphants sauvage de Birmanie, de l’Arunachal-Pradesh et du Karnataka (Inde)

Achevées

Institut Pasteur

Collaboration avec l’équipe de Jean-Pierre Vartanian: extraction et séquencage d’ADN nucléaire à partir de tissus anciens de mammouths laineux

Wildlife Conservation Society

Collaboration avec Ludovic Momont pour l’étude moléculaire des éléphants de la réserve de la Lopé au Gabon

Mission paléolithique française en Thaïlande

Collaboration avec ce groupe de recherche, mené par Valéry Zeitoun, pour des expertises taxinomiques de fossiles de proboscidiens récents (familles des Elephantidae et des Stegodontidae)

Eléphants en captivité

Collaboration avec un ensemble de 25 parcs zoologiques et de 2 cirques internationaux dans le cadre d’un programme d’analyse de la richesse et de la structure génétique des éléphants d’Afrique et d’Asie
détails ici>

Activités éditoriales

Rapporteur

Editeur

Co-Édition (avec Yann Bertrand) de la version électronique de La Reconstruction Phylogénétique de P. Darlu et P. Tassy.

Médiation scientifique

Version detaillée>

  • Exposition (“Au Temps des Mammouths”, exportée dans le monde entier)
  • Conférences publiques (en France et au Canada anglophone)
  • Interventions en milieu scolaire
  • Participations à la fête de la science (2001, 2004, 2005)
  • Ouvrages collectifs de vulgarisation
  • Participation éditoriale à des oeuvres de vulgarisation
  • Contenu pédagogique
  • Contributions presse (en France et à l’international)
  • Interventions télévisuelles (documentaires, reportages, actualités)
  • Interventions radiophoniques (interviews, actualités)

Activités associatives et sociétés savantes

2000-présent

Membre de la Société Francaise de Systématique (SFS); membre du bureau (2003-2006)

2009-présent

Membre du International Council for Archaeozoloogy (ICAZ)

2009-présent

Membre de la Society of Vertebrate Paleontology (SVP)

2008-2009

Membre de l’Association Canadienne d’Anthropologie Physique (ACAP/CAPA)

2004-2006

Membre de l’association naturaliste de l’Université Paris VI : Timarcha

2000-2004

Co-création et animation des “Rendez-vous de la baleine”, groupe de réflexion hebdomadaire sur l’évolution, destiné aux étudiants de 3ème cycle universitaire

1996-1999

Participation à la mission de soutien scolaire de l’association Welcome (Paris XI)

Activités extra-académiques

  • Activité de chroniqueur de l’actualité des littératures de l’imaginaire pour ActuSF
  • Poésie (concours Arthur Rimbaud 2003; édition dans “Le Laurier Vert”; Printemps des Poètes 2006)
  • Photographie et infographie amateur
  • Cuisine thaïe
  • Natation
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